萬歷十一年，申中族昂鎖從海南仰華寺迎請三世達賴索南嘉措來寺。達賴囑咐當時的寺院主持人宗哲堅贊桑布和施主們擴充寺院。寺院僧人各建住所，發展迅速，先后建成達賴行宮、三世達賴靈塔殿、九間殿、依怙殿、釋迦殿等。并于每年正月建立廟會。自此，佛殿逐年增加，塔爾寺初具規模。

俯瞰寺院

　　萬歷三十一年(1603)，四世達賴云丹嘉錯從蒙古去西藏，路過塔爾寺，當時，寺院附近居住的藏族有六個部落，四世達賴見寺院與民間村莊雜處，僧俗不分，乃任命當時的寺院主持人鄂賽爾嘉錯為第一任法臺，囑其分離僧俗，整飭教規。這是塔爾寺有法臺的開始。萬歷四十年正月廟會時，建立了“參尼扎倉”，即顯宗學經部門，開始了寺中的講學制度。崇禎二年(1629)修建了三十六柱的大經堂，此后得青海蒙、藏土司、千戶、百戶等屢次布施，寺院更漸次擴充，宗喀巴的紀念塔也由琉璃塔改修成了銀塔。清順治六年(1649)成立了“居巴扎倉”，即密宗學經部門�？滴跷迨�年(1711)成立了“曼巴扎倉”，即醫學部門。同年，青海蒙古王公額爾德尼布施黃金一千三百兩、白銀一萬余兩，改修大金瓦殿的屋頂為鎏金銅瓦。乾隆五年(1740)藏王頗羅鼐布施巨款重修大金瓦殿，并安裝了殿脊的金鹿、金輪、金幢等飾物。乾隆四十一年((1776))建造了寺前的如意寶塔。嘉慶七年(1802)重修護法神殿，換上鎏金銅瓦，形成了今日的小金瓦殿。嘉慶二十二年(1817年)建立“丁科扎倉”，即天文歷算部門。經過幾百年的擴建和修建，塔爾寺才逐步形成了今天擁有眾多的殿宇、經堂、佛塔和僧舍的龐大的寺廟建筑群。

八寶如意塔

　　無論從東山門、西山門還是從正門跨進塔爾寺，首先看到的都是位于寺前廣場的八寶如意塔。據說，這八座塔是為紀念佛祖釋迦牟尼一生之中的八大功德而建造的，建于1776年。其造型大同小異，塔身高6.4米，塔底周長9.4米，底座面積5.7平方米。塔身白灰抹面，底座青磚砌成，腰部裝飾有經文，每個塔身南面還有一個佛龕，里面藏有梵文。這8座塔分別是：1.蓮聚塔，藏語稱八邦。紀念釋迦牟尼初生時，步行7步，步步生蓮花之意。2.四諦塔，藏語稱扎西果莽。紀念釋迦牟尼初轉法輪，宣講四諦要義。3.和平塔，藏語稱彥敦。紀念釋迦牟尼平息僧眾爭論。4.菩提塔，藏語稱香趣。紀念釋迦牟尼悟道成正覺。5.神變塔，藏語稱窮處。紀念釋迦牟尼降伏外道魔怪的種種奇跡。6.降凡塔，藏語稱拉播。紀念釋迦牟尼重返人間超度眾生。7.勝利塔，藏語稱南結。紀念釋迦牟尼戰勝魔軍。8.涅槃塔，藏語稱娘德。紀念釋迦牟尼圓寂。 據說，塔爾寺的這8座塔內埋著該寺歷代高僧的衣冠，因此，各地信徒常來這里繞塔參拜，虔誠有加。